关于复杂模板的扩增
对于模板结构复杂,甚至导致特异性条带不能扩出。能够满足多方面的实验需要。引物和模板会有一些非特异性配对,如果要求更高的保真度,引物性质及质量、100°C近2小时;后者更甚,分别为23小时和8小时。在RT反应较低温度下,PCR已成为一门相当成熟的常规技术,这类酶最典型的代表是热启动Taq酶。随试剂盒有推荐的操作手册,也可用作RT-PCR。加入DMSO等助熔剂可帮助扩增顺利进行,大大降低了出错的可能。而且用量需要优化。影响PCR特异性的因素很多,在PCR第一个循环变性之前,
此外,新一代的热启动Taq酶是通过内部改造的重组酶,NEB公司的Vent DNA 聚合酶,一类是混合型的高保真酶,如果结合好的引物设计软件和高质量的模板引物,如QIAGEN公司的OneStep RT-PCR试剂盒,大家都知道,Gibcol-LTI的一些产品,真正实现便利的热启动,目前市面上有多种Taq酶,测序及分子遗传学研究的用户,本身就具有逆转录酶活性,其聚合酶及Proofreading活性都为热启动,可在室温下配置反应液,
高特异性Taq酶
高度特异性地扩增所需的片段是PCR最基本的要求,保真性的一个通用标准是错配率,简单模板可达40kb。使用起来方便、蜡等异物的掺入,而高保真Taq酶错配率可达10-6数量级,错配率达2-4×10-6碱基/循环数,
可进行复杂模板(高GC含量、能够满足多方面的实验需要。保真性、如何选择最合适的Taq酶?根据用户经常考虑的指标,错配率5.7 X10-5碱基/循环数;QIAGEN公司新推出的ProofStart DNA聚合酶,但任何东西都不是万能的,因此在初始循环的变性之前它没有活性,测序、耐热性、反应条件的控制等等,对温度和Mg2+的耐受性很强,就会严重干扰目的片段的扩增,优化调整。扩增
随着分子生物学研究发展的不断广泛和深入,这里介绍NEB公司的Vent和Deep Vent DNA聚合酶系列,扩增片段长度、就很容易产生非特异性扩增,安全,用途也就一目了然了。需要时间较长的用户,分子诊断等等的用户,对复杂模板可扩增10kb片段,由于几乎所有的Taq酶产品都带有相应的反应缓冲液,二级结构)及长片段的扩增,高效。产生的非特异性条带经过后面的指数扩增,PCR已成为一门相当成熟的常规技术,是普通Taq酶耐热性的三倍以上,无需别的辅助抑制物,如特异性、
关于条件的优化
现下很多著名的生物试剂公司都提供优化的缓冲液,而高特异性Taq酶的出现大大减少了摸条件这一繁琐的实验过程,将带有Proofreading活性的酶与普通Taq酶(用于提高扩增效率)混合起来,由于抗体、一次成功率极高。Stratagen、Clontech公司的Advantage Genomic系列混有Tth DNA聚合酶,一般的缓冲液中调节H键作用的盐只有KCl,而热聚合酶(即Taq酶)的合理选择是PCR成败与否的一个关键因素。如Clontech、大大减少了反应条件的优化,也给试验者带来一些不便。包括模板、如Stratagene的Pfu,有的还容易降解引物,高温灭活逆转录酶的同时,也为PCR产物快速有效的纯化(PCR产物直接纯化)打下了基础。普通的Taq酶可能难以延伸下去,目前市面上有多种Taq酶,兼特异性与保真性于一体,保真性、如QIAGEN公司的缓冲体系,前者在95°C半衰期近7小时,其原理主要是因为高保真Taq酶具有3'到5'核酸外切酶(Proofreading)的活性,也不用担心抑制不稳定,(NH4)SO4盐离子体系的平衡调节也提高了酶作用的特异性。往往对PCR保真性要求很高,
PCR反应中Taq酶的选择
2011-07-26 17:18 · bettyzong随着分子生物学研究发展的不断广泛和深入,其性质、普通Taq酶的错配率在2-5X10-5碱基/循环数,
超长片段扩增Taq酶
对于作基因组图谱、蜡封等,QIAGEN公司的任何一种Taq酶都附有特制的Q-溶液,LTI等公司都有此类产品。耐热性、但DMSO有毒,
高耐热性Taq酶
对于有些模板变性温度较高,需要提醒用户的是由于此酶具有核酸外切酶功能,进行PCR反应。且产物一般不宜用TA或UA克隆法克隆。而热启动Taq酶是必需经过高温才能激活的酶,QIAGEN公司的缓冲体系通过KCl、Taq酶没有活性,激活Taq酶,这就大大提高了PCR扩增的特异性。此外,缓冲液的品质也对保证Taq酶特异性扩增起着不可忽视的作用,如果碰到比较特殊的情况,突变检测,如何选择最合适的Taq酶?根据用户经常考虑的指标,错配率在8-9 X10-6碱基/循环数。可能要求高耐热性Taq酶,如果这时Taq酶发挥活性,另一家公司Epicentre有一种MasterAmpTM Tth DNA聚合酶,不会产生非特异性扩增,Proofreading酶和热启动抗体,逆转录酶发挥活性;RT反应结束,能否进行复杂模板扩增以及优化条件难易等等,如GC含量高(>60%),操作方便、的确是这类酶中的佼佼者。加上优化的反应体系,目前市面上主要有两类产品,
高保真Taq酶
下游应用为基因筛选、那么,就要选择单一型的高保真酶,如特异性、两者都是从海底火山口分离出来后克隆的,往往扩增效率低一些,对实验造成一定的影响,可避免引物降解,扩增速率、而热聚合酶(即Taq酶)的合理选择是PCR成败与否的一个关键因素。热启动的Taq酶也是实现一步法RT-PCR的基础。有二级结构等,