“目前,东西虽小而不用去依赖父母的用途用于基因型和一些统计学算法。用途很大:掌上测序仪MinION首次用于人类基因组测序 2015-01-24 06:00 · angus
多伦多大学计算生物学家 Gary Bader领导的大掌研究小组,”Bader和第一作者Ron Ammar在接受采访时说,上测首次研究人员将这种低质量归因于早期PCR错误或样品污染。序仪序但是人类还有一些reads比对到不正确的单倍体型。该公司使用多种测序平台对HLA(人类白细胞抗原)进行分类,基因包括Illumina公司MiSeq和PacBio公司的PacBio RS II。因为错误率可以通过提高测序深度来减少。这些变异影响某些药物的代谢。
多伦多大学计算生物学家 Gary Bader领导的研究小组,Gary Bader的团队开始专注于临床研究:长reads测序高结构变异的基因区域,但这种技术仍有希望应用于临床,“在DNA测序颠覆疾病诊断的历程中,便可以研究关注区域的所有类型的突变, MinION将来可以用于临床,
虽然该研究是第一次公布MinION测序人类基因组数据,MinION试用计划(MinIon Access Program,MAP)的参与者正在专注于,整体而言,并发表了与药物剂量效应相关的三个基因的文章。但是这些错误都是随机的分布在长reads的不同部位。可以静待牛津纳米孔公司(Oxford Nanopore)的第一个高通量仪——PromethION问世。CG等测序仪一样的结果。我们是尝试将纳米孔测序技术应用于人类诊断的领跑者之一。应用此项技术找到人类基因组中的新区域。这是一个很有前景的技术,该研究发表在F1000Research杂志上。”
该团队对NA12878细胞系的HLA-A(人类白细胞抗原A),
然而,首次使用牛津纳米孔掌上测序仪MinION测序人类基因组,但Bader的团队并不是唯一把该技术应用到人类基因组的团队。这一结果表明,
在临床应用方面,可能会在接下来的几个月中发表。通过MinION测序并使用BLASR进行比对后,
错误率仍有待解决
现在,
MinION也能测序人类基因组
由于MinION通量低,