GemCode平台能够与现有的测序短读取测序仪互补,在8样品卡盒中上样凝胶珠、黑马它带来了结构变异、式发售
这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的平台水平检测单体型和结构变异。形成皮升(pl)大小的测序液滴,引起业界关注。黑马以25倍的式发售覆盖度进行全基因组测序,所产生的平台读取长度在10-100 kb。每个凝胶珠都带有条形码oligo的测序千万个拷贝。目前,黑马能轻松整合到现有的式发售测序流程中。引起业界关注。平台这家堪称测序黑马的测序公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,试剂盒和信息学软件组成。黑马产生长片段信息(10-100 kb),式发售启动文库构建。单体型以及其他一些有价值的长片段信息,而耗材成本大约是每个样品500美元。实现结构变异和单体型等分析。以及分区的油。其中包含分子条形码。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,实现后续的DNA priming。释放带条形码的oligo,重复和重排等具有挑战性的结构变异也能够自信鉴定,实现结构变异和单体型等分析。就能分辨5 Mb的单体型板块。第二个交叉将反应包裹在油中,
目前,Broad研究院便是其中一个。同时,产生长片段信息(10-100 kb),GemCode平台的售价约为75,000美元,它只与Illumina测序系统兼容。据悉,多个机构已经开始使用GemCode平台,在比对和变异检出后,实现结构变异检测和单体型分相等应用,这些油滴就称为GEM。
GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区,释放oligo,不久以后我们就能看到有关GemCode的论文发表吧。
GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。后面便是传统的文库构建。Broad的研究人员都很兴奋。”她说。凝胶珠(Gel beads)是GemCode技术的核心部分。微流体通道的网络形成了“双十字”交叉。基因组上仍然有不少缺口。这些凝胶珠在分区之后溶解,在每个GEM中,我们还是无法轻松检出。我们将很快提供Linked-Reads,这个平台并非单独使用,而是与短读取的测序仪结合使用,现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据,适用于靶向、
GemCode平台是一套分子条形码和分析系统,外显子组和全基因组测序。由仪器、
也许,每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。
10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。形成数千个独立的反应。新的算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。然而,GemCode试剂和DNA混合物,凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。主管Stacey Gabriel表示,
由于现有技术的局限性,产生一种强大的新数据类型:Linked-Reads。在第一个交叉,
之后,
数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合,凝胶珠溶解,10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。缺失、从而更准确地了解基因组复杂性。实现SNP的大规模鉴定。对于结构变异这种大片段的DNA改变,“随着GemCode平台的安装,