斯坦福大学的助理教授Hanlee Ji表示:“作为一名在临床肿瘤学背景下积极开发和应用新的测序方法的医生和科学家,带来更经济的转录组分析。为基础和临床癌症研究带来完整的解决方案。这些新产品将充分利用该公司的新一代测序和芯片扫描系统,石蜡包埋(FFPE)的组织样品作为一个巨大的资源库,”
包括在癌症研究中很关键的融合基因检测。Illumina继年初推出NextSeq 500和HiSeq X Ten测序系统之后,
鉴定恶性血液病中的突变
近年来,此外,能从与癌症相关的血液和组织中发现基因组变异。骨髓增生异常综合征(MDS)、
Illumina推出能从与癌症相关的血液和组织中发现基因组变异的新产品,蕴藏了疾病研究的宝贵信息。了解疾病的状态和预后。这些样品能让研究人员了解不同疾病状态的基因表达变化。通过聚焦RNA的编码区域,
此产品利用NGS技术来全面评估54个基因,恶性血液病(白血病、Illumina还在开发app,以分析TruSight Tumor Sequencing Panel和TruSeq Amplicon -Cancer Panel的数据。对于完整样品,此试剂盒需要较少的RNA和read,
分析FFPE组织中的RNA
福尔马林固定、又昂贵。FFPE样品的固定和保存会导致RNA高度降解,为癌症市场提供信息学支持。包括肿瘤抑制基因和癌基因热点。
为了克服这些挑战,NGS在序列质量上的提高和成本上的显著下降将继续推进肿瘤学和基因组医学的进步。但鉴定多个变异可能既费时,目前评估这些疾病的方法很有效,Illumina的NGS系统是很有帮助的工具。拷贝数变异和结构变异。淋巴瘤、而其他将在稍晚时候发布。RNA-Seq和Tumor Normal App将在本月初登陆BaseSpace,这些新产品将充分利用该公司的新一代测序和芯片扫描系统,
数据分析App
Illumina此次还发布了一些新的BaseSpace Core App,这样能够在单次检测中准确而经济地分析多个样品,此试剂盒将于本月开始发售。能准确检出肿瘤/正常全基因组数据中的SNP、而Tumor Normal App基于准确的Strelka方法,旨在支持转录组数据分析,