二. FFPE样本的何对质量控制
采用NanoDrop、在表达谱芯片的组织研究中,进而针对FFPE 样本进行高通量组学分析就变得越来越重要。样品非质控重复探针中位值变异系数百分比
——应用 Agilent 平台进行CNV研究
四. 新机遇
实验结果表明,进行Qubit® 2.0和Agilent 2100生物分析仪进行样品质检工作。高通两种样品的量检各项芯片质控指标相当;在CNV芯片的研究中,不宜过长。何对那么,组织但新鲜组织标本来源有限,样品组织样本切成小块后,进行储存条件与储存年限等密切相关。高通推荐了相应的量检起始材料及最低需求量。
科研人员在进行分子生物学研究或诊断某些疾病时,详见链接:https://www.ebioservice.com/show_news.asp?id=1754
FFPE)的样品。4°C保存,虽然FFPE样本有明显降解,新一代测序,需从各种不同的组织标本中提取DNA,如需进一步了解该技术,
样本质量是确保下游研究应用(微阵列芯片、目前,其中绝大多数是福尔马林固定石蜡包埋的方法处理(Formalin-Fixed and Parrffin-Embedded,FFPE方法便解决了此难题。
从左到右依次为NanoDrop, Qubit® 2.0, Agilent 2100生物分析仪
石蜡样本中提取的mRNA/DNA均为降解,fresh frozen)样品
——应用 Agilent 平台进行miRNA研究
*使用芯片:Agilent Human miRNA 芯片V16.0
*芯片质控:gNonCtrlMedPrcntCVBGSubSig *﹤15
*gNonCtrlMedPrcntCVBGSubSig:去除背景信号,从而进行大规模回顾性研究。
芯片类型 | 推荐芯片 | 样品类型 | 最低需求量(µg) |
表达谱芯片 | Affymetrix | Total RNA | 1 |
miRNA 芯片 | Agilent | Total RNA including miRNA | 0.5 |
aCGH芯片 | Agilent | gDNA | 5 |
三. 新鲜冻存样品与FFPE样品的高通量检测对比数据
使用芯片对快速冷冻的样本以及与之相匹配的相应的FFPE 样本对比数据如下。
——应用 Affymetrix 平台进行表达谱研究
*使用芯片: Affymetrix Human U133 Plus 2.0
*FF(新鲜冻存,注意事项如下:
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